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1. 蛋白质组学数据分析笔记说明
2. 蛋白质组学的研究内容
3. 蛋白质组研究的研究内容

1、蛋白质组学数据分析笔记说明

建立了基于QE，Fusion的DIA数据采集以及数据分析流程，实现了7500个蛋白的DIA定量分析。

大伙儿都知道，蛋白质组学（proteomics），是研究一种细胞或者一种生物体所表达的全部蛋白质。

将蛋白质组数据与其他组学数据（如转录组或代谢组数据）进行整合，从多层面理解差异蛋白的生物学含义。 生物标志物筛选 如果研究的目标是寻找疾病的生物标志物，进一步分析差异蛋白的诊断、预测和治疗价值。

分子）的关系。因此蛋白质组学的研究通常是高通量的。

2、蛋白质组学的研究内容

主要有两方面，一是结构蛋白质组学，二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面：① 针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞，建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群，即组成性蛋白质组学。

蛋白质组学的研究策略主要包括如下：质谱法：通过测量蛋白质的质量来研究其特性，包括串联质谱技术（MS/MS）用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。

蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。翻译后修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化，糖基化，酶原激活等。

对人类而言，蛋白质组学的研究最终要服务于人类的健康，主要指促进分子医学的发展。如寻找药物的靶分子。很多药物本身就是蛋白质，而很多药物的靶分子也是蛋白质。药物也可以干预蛋白质-蛋白质相互作用。

3、蛋白质组研究的研究内容

蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。翻译后修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化，糖基化，酶原激活等。

蛋白质组学的研究内容包括：蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Westemn等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

蛋白质组学的研究策略主要包括如下：质谱法：通过测量蛋白质的质量来研究其特性，包括串联质谱技术（MS/MS）用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。

早期蛋白质组学的研究范围主要是指蛋白质的表达模式（Expression profile），随着学科的发展，蛋白质组学的研究范围也在不断完善和扩充。蛋白质翻译后修饰研究已成为蛋白质组研究中的重要部分和巨大挑战。

本书主要介绍蛋白质组学的基本理论、主要研究内容作在医药研究中的作用。分为两个部分，第一部分为基础理论，共有九章，其中第二章介绍了蛋白质组研究产生的基础、发展的历史、取得的成就以及目前还存在的问题。

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