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1. 2019-11-12 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述(上)
2. 蛋白质组学定量 Normalization 方法之一
3. 蛋白质组学研究的主要步骤
4. 试述如何应用2D-PAGE进行差异蛋白质组学的研究,并分析其优缺点。_百...
5. 什么是蛋白质组学的基本技术流程

1、2019-11-12 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述(上)

这次课程的授课老师完全可以用青年才俊四个字来形容：她于2014年博士毕业于德国慕尼黑工业大学（Technische Universitt München）生物分析与蛋白质组学研究所，师从领域的大牛Prof. Bernhard Kuster。

对于蛋白质组学研究来讲，我们对质谱仪器性能的最低要求是：分辨率至少在40，000-50，000，质量准确性应该优于5ppm，质量扫描范围应该在100-3，000，扫描速度是每秒至少获得一张高分辨的一级谱图和十张高分辨的二级谱图。

2、蛋白质组学定量 Normalization 方法之一

间接测定法：蛋白质与某些酸性或碱性色素分子结合形成不溶性的盐沉淀。用分光光度计测定未结合的色素，以每克样品结合色素的量来表示蛋白质含量的多少。

质谱法：通过测量蛋白质的质量来研究其特性，包括串联质谱技术（MS/MS）用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。蛋白质互作网络分析：研究蛋白质间的相互作用，揭示蛋白质在细胞内不同通路中的相互作用和功能。

蛋白质组学的研究方法有蛋白质鉴定、翻译后修饰、蛋白质功能确定、蛋白质靶向定量技术。蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

蛋白组学的研究方法如下：蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否，很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。

3、蛋白质组学研究的主要步骤

在应用2D-PAGE研究差异蛋白质组学问题时首先要获得要进行差异比较的组织，如肿瘤组织与癌旁正常组织，然后裂解组织和细胞，抑制蛋白酶活性，出去非蛋白质的DNA，RNA，脂类等物质，溶解蛋白质，溶解并抽提总蛋白质。

蛋白质组学的基本技术流程主要为以下四方面：蛋白质标本的制备及分离：寻找较好的方法尽可能完全地抽提细胞或组织中的全部蛋白质是比较蛋白质组学研究的重要前提。

蛋白质组学的研究方法有蛋白质鉴定、翻译后修饰、蛋白质功能确定、蛋白质靶向定量技术。蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

蛋白质组学的基本技术流程主要为以下四方面。

蛋白质组学的研究策略主要包括如下：质谱法：通过测量蛋白质的质量来研究其特性，包括串联质谱技术（MS/MS）用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。

4、试述如何应用2D-PAGE进行差异蛋白质组学的研究,并分析其优缺点。_百...

质谱技术MS：是目前分析蛋白质的主要手段之一。质谱技术可以检测蛋白质的质量、序列、修饰和定量等信息，包括基于母离子扫描MS和tandem MS（MS/MS）等多种方法。

双向聚丙烯酰胺凝胶电泳（2D-PAGE）2D-PAGE方法的应用始于20世纪70年代（OFarrell等，1975年），但迄今为止，它仍然是分离蛋白质的最有效的方法。

使用工具如KEGG、Reactome等，研究差异蛋白在生物通路中的角色。（2）识别受影响的生物通路或与特定疾病、功能相关的通路。互作网络分析：（1）利用如STRING、BioGRID等数据库，构建蛋白质之间的相互作用网络。

生物质谱 生物质谱技术是蛋白质组学研究中最重要的鉴定技术，其基本原理是样品分子离子化后，根据不同离子之间的荷质比（M/E）的差异来分离并确定分子量。

5、什么是蛋白质组学的基本技术流程

蛋白质组学的基本技术流程主要为以下四方面。

蛋白质样品的制备：蛋白质样品的制备是蛋白质组学研究的首要环节，也是最为重要的部分。蛋白质样品的质量直接影响到科学研究的真实性和可信度。

LCM-二维电泳·质道的技术路线是典型的一条蛋白质组学研究的技术路线，除此以外，LCM-抗体芯片也是一条重要的蛋白质组学研究的技术路线。

蛋白质组学研究的基础技术主要包括以下两个方面：二维电泳 （2-DE）：二维电泳是一个用于分离蛋白质的技术，其中第一维度是按照蛋白质的等电点分离，而第二维度是按照蛋白质的分子量分离。

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