蛋白质组学基因组学糖组学,基因组与蛋白质组学
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1、蛋白质组学简介
【答案】: 蛋白质组学(Proteomics):指在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质表达水平,翻译后修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。
蛋白质组学技术于1996年由澳大利亚学者Wilkins等最早提出。
概念 蛋白质组学是阐明生物体各种生物基因组在细胞中表达的全部蛋白质的表达模式及功能模式的学科;包括鉴定蛋白质的表达、存在方式(修饰形式)、结构、功能和相互作用等。
蛋白质组学研究的基本技术 对于蛋白质组学的研究来说,它的最基本的实验手段就是利用双向凝胶电泳(two-dimensional protein electrophoresis, 2DE),在整个 基因组水平上检测蛋白质表达的情况。
2、四大组学如何筛选分子标志物
验证上述筛选出的生物标志物组,或选择特定的生物标志物组,计算区分效果(AUC)值。可以从构建的最佳生物标志物组中进一步选择样本进行验证,也可以手动选择生物标志物组进行分析。
二维凝胶电泳(2DE):2-DE 是一种比较常见的蛋白质分离和纯化技术,能够将复杂的蛋白质混合物进行高效分离,并且能够定量检测不同样品中蛋白质的差异表达。
随着现代分子生物学和细胞生物学在癌症研究中的广泛应用,癌症的发生机制正在逐渐被揭示。癌症的早期诊断和早期治疗呼唤灵敏、特异的肿瘤标志物的发现,研究癌症相关蛋白的修饰由于可能导致发现新的特异抗癌药物靶蛋白而备受关注。
MALDI的基本原理是将分析物分散在基质分子(尼古丁酸及其同系物)中并形成晶体,当用激光(337nm的氮激光)照射晶体时,基质分子吸收激光能量,样品解吸附,基质-样品之间发生电荷转移使样品分子电离。
3、简述生物信息学在基因组学中的应用
生物信息学中用于基因组演化研究的方法包括序列比对、基因家族聚类、系统进化分析等。转录组学 转录组学是研究基因转录过程的全面性和动态性的学科。
在基因组学研究中的应用 基因组(genome)表示一个生物体所有的遗传信息的总和。一个生物体基因所包含的信息决定了该生物体的生长发育、繁殖和消亡等所有生命现象。
基因组信息学的首要任务之一就是发现新的基因。
生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息 。
4、组学分析包括哪些
蛋白组学是研究生物体内所有蛋白质的结构、功能、数量和相互作用,其分析技术包括:质谱技术MS:是目前分析蛋白质的主要手段之一。
研究蛋白质间相互作用的主要技术总结如下:酵母双杂交系统酵母双杂交系统是当前广泛用于蛋白质相互作用组学研究的一种重要方法。
目前常用的质谱包括两种:基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)和电喷雾质谱(ESI- MS)。飞行时间质谱 MALDI 的电离方式是 Karas和Hillenkamp于1988年提出。
代谢组学分析如下:代谢组学研究可分为两类:“发现代谢组学”(也称“非靶向代谢组学”)和“靶向代谢组学”。
基因组学的主要工具和方法包括:生物信息学,遗传分析,基因表达测量和基因功能鉴定。基因组学出现于1980年代,1990年代随着几个物种基因组计划的启动,基因组学取得长足发展。相关领域是遗传学,其研究基因以及在遗传中的功能。
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