磷酸化蛋白质组学富集方法,解读磷酸化蛋白western图
大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于磷酸化蛋白质组学富集方法的问题,于是小编就整理了5个相关介绍磷酸化蛋白质组学富集方法的解答,让我们一起看看吧。
1、列举研究蛋白质磷酸化的主要实验方法并比较其优缺点。
质谱分析(MS):质谱分析是一种直接鉴定磷酸化蛋白质和磷酸化位点的高效方法。它可以用于鉴定全体磷酸化蛋白质的组成,也可以用于鉴定特定磷酸化位点。
质谱 首先,磷酸化肽段的信号通常较弱,因为它们带负电荷,而电喷雾质谱在正电模式下作用,因此电离效果不好。其次,在大量非磷酸化蛋白的高背景之下,很难观察到低丰度目的蛋白的信号。
1 磷酸化蛋白的富集 过 去 关 于 磷 酸化蛋白富集的方法主要应用针对特 定蛋白的抗体进行免疫沉淀。但该法需要首先对 蛋 白有所了解,且不适合大规模研究。
有磷酸化的抗体,磷酸化抗体可以识别蛋白质的磷酸化或者非磷酸化形式,而且可以在避免放射污染的情况下,对磷酸化蛋白进行定性和定量分析,因此特异性磷酸化抗体是研究蛋白质磷酸化的重要工具。
2、磷酸化蛋白组学需要多少蛋白
虽然对磷酸化蛋白质组学分析已有很大进步,但依然存在多个难点19待解决包括磷酸化蛋白和肤段的富集,可逆性磷酸化位点的鉴定以及磷酸化位点的定量等。1 磷酸化蛋白的识别 磷 酸 化 蛋白在细胞中含量甚微。
一定要在lysis buffer中加入蛋白酶抑制剂,还要加入一定量的磷酸酶抑制剂,否则即使条带压出来也会很浅,结果也不可信。加一抗后最好4度过夜,保证抗体有充分的结合时间。因为磷酸化的蛋白只占总的蛋白量的极少部分。
在大规模人胎肝蛋白表达谱方面初步鉴定出500个高丰度蛋白,150个磷酸化相关蛋白等等。这些研究证明了我国的蛋白质组学技术平台已能支撑一定规模的研究,为我国在该研究领域争得了一席之地,也为未来的发展奠定了良好的基础。
核酸排序就是ATGC的各种组合,但是蛋白质组学涉及的常用氨基酸就有20多种,这个排序下来复杂度高多了,蛋白还存在各种翻译后修饰,高级结构等等。而且蛋白质没有核酸稳定,容易降解,研究起来更难获得重复性好的结果。
3、分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术
磷 酸 化 蛋白在细胞中含量甚微。在质谱分析中,磷酸化肚段的信号往往被非磷酸化肤段的信号所抑制。因而磷酸化蛋白和肤段的富集在提高磷酸化 位点的检测中占有非常重要的地位。
利用分子生物学技术,已克隆出100多个蛋白激酶的基因。有些已通过测定其核苷酸序列而推出其相应的氨基酸序列。
蛋白质的磷酸化反应是指通过酶促反应把磷酸基团从一个化合物转移到另一个化合物上的过程,是生物体内存在的一种普遍的调节方式,在细胞信号的传递过程中占有极其重要的地位。
以蛋白质磷酸化激活为例,蛋白质分子的变化不是仅仅磷酸化/非磷酸化(激活/失活)两种状态之间开关式变化,而是一个构象动态变化的过程,微弱的结构变化如何引起显著的功能改变,这是分子生物学所不及的,需要分子动力学研究。
4、简述检测蛋白质磷酸化的检测方法及其原理
亲和层析法:利用含有亲和材料的柱子将磷酸化蛋白质从混合物中纯化出来。然后,通过Western blotting或质谱分析等方法确定其磷酸化状态。这些方法各有优缺点,选择合适的方法要考虑样品性质、实验目的和设备可用性等因素。
基本原理就是设计个bait将目的蛋白留在柱子上或沉淀下来。
目前研究蛋白质磷酸的方法有放射性同位素标记、生物质谱分析等多种方法。
检测 蛋 白 混合物中磷酸化蛋白的经典方法是先 行电泳分离蛋白质,然后用放射自显影术或针对磷 酸化蛋白的免疫印记方法来检测。近来,Pro-Q Diaround 磷酸化蛋白胶染色是一项重大的技术突 。破b]。
有磷酸化的抗体,磷酸化抗体可以识别蛋白质的磷酸化或者非磷酸化形式,而且可以在避免放射污染的情况下,对磷酸化蛋白进行定性和定量分析,因此特异性磷酸化抗体是研究蛋白质磷酸化的重要工具。
5、磷酸化蛋白质的鉴定方法?
其他传统方法包括2D凝胶电泳,这种技术假定磷酸化会改变蛋白的迁移率和等电点。WesternBlot 利用SDS-PAGE分离生物样品,随后转移到膜上(通常是PVDF或尼龙膜),之后利用磷酸化特异的抗体来鉴定目的蛋白。
目前研究蛋白质磷酸的方法有放射性同位素标记、生物质谱分析等多种方法。
磷酸化抗体可以识别蛋白质的磷酸化或者非磷酸化形式,而且可以在避免放射污染的情况下,对磷酸化蛋白进行定性和定量分析,因此特异性磷酸化抗体是研究蛋白质磷酸化的重要工具。
可以使用蛋白磷酸化水平检测试剂盒(BSP061)或磷酸化蛋白凝胶检测试剂盒(BSP043)来区分蛋白质是否已经磷酸化或者已经脱磷酸化 。
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