大家好，今天小编关注到一个比较有意思的话题，就是关于蛋白质组学怎么用go分析的问题，于是小编就整理了1个相关介绍蛋白质组学怎么用go分析的解答，让我们一起看看吧。

1. 怎样对一组蛋白或基因做GO分析

1、怎样对一组蛋白或基因做GO分析

Pathway功能分析及显著性判断 对差异表达基因进行Pathway功能分析，并计算Pvalue进行显著性判断，Pvalue越小，表明该pathway变化越显著，并可对每条Pathway通路图进行展示，同时在相应的位置标注差异表达基因。

准备输入数据 待分析的数据就是一串基因名称了，可以是ensembl id、entrze id或者symbol id等类型都可以。把基因名称以一列的形式排开，放在一个文本文件中（例如命名“gene.txt”）。

step 1：计算富集得分（Enrichment Score）。按顺序从头到尾逐个比较L中的基因与S中的基因，加和统计量，如果两者相同就增加KS统计量，反之就减少KS统计量。增加的多少与这个基因和表型的相关性有关。

生物过程 （biological process）和细胞组成（cellular component ）三个部分。蛋白质或者基因可以通过ID对应或者序列注释的方法找到与之对应的GO号，而GO号可对于到Term，即功能类别或者细胞定位。

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