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蛋白质组学是一个开放-蛋白质组学的原理

蛋白质组学是一个开放-蛋白质组学的原理

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  1. 1. 蛋白质组学研究方法概述(上)
  2. 什么是蛋白质组学?
  3. bmc biology
  4. 蛋白质组组学研究的基本策略是什么?
  5. 为什么要进行蛋白质组的研究

1、1. 蛋白质组学研究方法概述(上)

也就十几年的时间吧,蛋白质组学的研究目标从细胞模型、动物模型,到人的体液、组织等人体样本,应用范围的生物复杂度越来越高。

这次课程的授课老师完全可以用青年才俊四个字来形容:她于2014年博士毕业于德国慕尼黑工业大学(Technische Universitt München)生物分析与蛋白质组学研究所,师从领域的大牛Prof. Bernhard Kuster。

蛋白质组学的研究方法有蛋白质鉴定、翻译后修饰、蛋白质功能确定、蛋白质靶向定量技术。蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

蛋白质组学的研究策略主要包括如下:质谱法:通过测量蛋白质的质量来研究其特性,包括串联质谱技术(MS/MS)用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。

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2、什么是蛋白质组学?

蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。

概念 蛋白质组学是阐明生物体各种生物基因组在细胞中表达的全部蛋白质的表达模式及功能模式的学科;包括鉴定蛋白质的表达、存在方式(修饰形式)、结构、功能和相互作用等。

蛋白质组学研究的基本技术 对于蛋白质组学的研究来说,它的最基本的实验手段就是利用双向凝胶电泳(two-dimensional protein electrophoresis, 2DE),在整个 基因组水平上检测蛋白质表达的情况。

蛋白质:是一类生物大分子,由一条或多条肽链组成,每条肽链都由一定数量的氨基酸按一定顺序通过肽键连接而成。

大伙儿都知道,蛋白质组学(proteomics),是研究一种细胞或者一种生物体所表达的全部蛋白质。

3、bmc biology

Bmc biology翻译为:BMC生物学。详细内容如下:BMC生物学是一个开放获取的学术期刊,涵盖了生物学型绝唤领域的各个方面。该期刊由BioMed Central出版,旨在促进高质量的研究并加快科学发现的传播。

bmcpublichealth不是水刊。根据查询相关公开信息,bmcpublichealth是网络版杂志。bmcpublichealth是生物医学领域的一家独立的新型出版社,以出版网络版期刊为主,目前出版120种生物学和医学领域的期刊。

BMC的分子生物学 是一本不错的生物分析杂志,具体的可以去杂志铺订阅看看。

Bioinformatics BMC Bioinformatics Plos Computational Biology 这三个比较有名,而且是专门bioinformatics的期刊。下面几个也很有名,但是不是专门bioinformatics的,只是不少bioinfo的也往上面发。

4、蛋白质组组学研究的基本策略是什么?

蛋白质组学的研究策略主要包括如下:质谱法:通过测量蛋白质的质量来研究其特性,包括串联质谱技术(MS/MS)用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。

蛋白质组学的研究方法有蛋白质鉴定、翻译后修饰、蛋白质功能确定、蛋白质靶向定量技术。蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

对人类而言,蛋白质组学的研究最终要服务于人类的健康,主要指促进分子医学的发展,如寻找药物的把分子。很多药物本身就是蛋白质,而很务药物的靶分子也是蛋白质。药物也可以干预蛋白质-蛋白质相互作用。

蛋白质组的研究实质上是在细胞水平上对蛋白质进行大规模的平行分离和分析,往往要同时处理成千上万种蛋白质。因此,发展高通量、高灵敏度、高准确性的研究技术平台是现在乃至相当一段时间内蛋白质组学研究中的主要任务。

蛋白质样品的制备:蛋白质样品的制备是蛋白质组学研究的首要环节,也是最为重要的部分。蛋白质样品的质量直接影响到科学研究的真实性和可信度。

5、为什么要进行蛋白质组的研究

主要有两方面,一是结构蛋白质组学,二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面:① 针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞,建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群,即组成性蛋白质组学。

因此要对生命的复杂活动有全面和深入的认识,必然要在整体、动态、网络的水平上对蛋白质进行研究。

年代初期,各种技术已比较成熟,在这样的背景下,经过各国科学家的讨论,才提出蛋白质组这一概念。国际上蛋白质组研究进展十分迅速,不论基础理论还是技术方法,都在不断进步和完善。

举个例子,癌症的遗传学背景需要和掌控细胞增殖的蛋白质进行整合。但是癌症的特征在于它是一种蛋白质复合物的失调和功能障碍。很难想象还有比蛋白质组学更适合的学科,可以将生命原理和疾病整合在一起。

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