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蛋白质组学晶体数据库(蛋白质 晶体)

蛋白质组学晶体数据库(蛋白质 晶体)

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  1. 蛋白质组学目前有哪些数据库
  2. PDB数据库网址是什么?
  3. PDB数据库简介

1、蛋白质组学目前有哪些数据库

蛋白质结构数据库 包含来自X线晶体学和三维结构的实验数据。其数据从PDB(Protein Data Bank)获得。

PIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库,可在这里下载。

蛋白质数据库(Protein Data Bank, PDB)是一个生物大分子,如蛋白质和核酸,的数据库。

即UniRef100、UniRef90和UniRef50;■ (3) UniParc (UniProt Archive),是UniProt存档库 ,收录所有蛋白质序列。用户可以通过文本查询数据库,可以利用BLAST程序搜索数据库,也可以直接通过FTP下载数据。

2、PDB数据库网址是什么?

员可通过访问其网址www.uniprot.org,免费获取信息。(新浪网 2002年11月01日)蛋白质数据库(Protein Data Bank, PDB)是一个生物大分子,如蛋白质和核酸,的数据库。

RCSB的PDB数据库网址是:http://www.rcsb.org/pdb/。 SCOP 蛋白质结构分类(SCOP)数据库详细描述了已知的蛋白质结构之间的关系。

PDB是Palm DataBase的缩写,Palm OS所用文件的扩展名为.pdb。可以使用PalmReader打开。 如果想把PDB文件转换成TXT文件查看,可以使用WavePDB转。

在右边可以看到“符号文件(.pdb)的位置”的字样,给“MicroSoft符号服务器”打勾,如下图所示,点击确定保存退出。在主界面可以看到正在从microsoft服务器下载.pdb符号文件,vs也正在加载这些符号文件。

3、PDB数据库简介

PDB(Program DataBase),全称为“程序数据库”文件,是VS编译链接时生成的文件。DPB文件主要存储了VS调试程序时所需要的基本信息,主要包括源文件名、变量名、函数名、FPO(帧指针)、对应的行号等等。

pdb是程序数据库文件。pdb的全称为palm database,为palm os操作系统中的数据文件类型。通常我们在使用palm系统的电子书时都会使用到此文件。

PDB是目前最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)5维(以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库,是通过X射线单晶衍射、核磁共振、电子衍射等实验手段确定的蛋白质、多糖、核酸、病毒等生物大分子的三维结构数据库。

PDB是由世界蛋白质数据库(Worldwide Protein Data Bank,wwPDB)管理。

程序数据库 (PDB) 文件保存着调试和项目状态信息,使用这些信息可以对程序的调试配置进行增量链接。

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