蛋白质组学应用举例,蛋白质组学原理及应用
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1、如何将蛋白质组学应用在自己的课题中
质谱法:通过测量蛋白质的质量来研究其特性,包括串联质谱技术(MS/MS)用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。蛋白质互作网络分析:研究蛋白质间的相互作用,揭示蛋白质在细胞内不同通路中的相互作用和功能。
当然通过结合2DE和MS为基础的方法蛋白质组学获得最低点的功能。一个代表性的结合例子是Hochstrasser研究组[15]所发展的系统,整个2DE凝胶进行原位消化,电转移到膜上并直接用MS扫描,生成注释的2D图谱。
临床蛋白质组学的应用方向 在肿瘤学研究中,组织分析能够最准确地反映肿瘤的生理状态,发现生物标志物、生物学通路,并与现有的基因组学和转录组学结果整合做多组学分析。这类研究通常使用同一患者的癌组织样品和癌旁“健康”对照样品比较寻找潜在的诊断biomarker。同时,对不同癌症分期患者比较获得预后信息。
目前蛋白质组学研究在表达蛋白质组学方面研究的最为广泛,其分析通常有三个步骤:第一步、运用2-DE技术分离样品中的蛋白质;第二步、应用质谱技术或N末端测序鉴定2-DE分离的蛋白质;第三步、应用生物信息学技术存储、处理、比较获得的数据。
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