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蛋白质组学数据生信分析(蛋白质组数据处理)

蛋白质组学数据生信分析(蛋白质组数据处理)

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  1. 如何利用生物信息学研究一个蛋白分子

1、如何利用生物信息学研究一个蛋白分子

预测蛋白质的亚细胞定位,是通过生物信息学的方法的。 或者你在NCBI数据库中比对到了编码类似蛋白的基因,如果该基因有人做过亚细胞定位的实验,你也可以大概知道其编码的蛋白质在细胞内部的定位。不同物种,不同基因家族成员有可能有区别。

分子进化和比较基因组学,是最重要的课题之一 早期的工作主要是利用不同物种中同一种基因序列的异同来研究生物的进化,构建进化树。既可以用DNA序列也可以用其编码的氨基酸序列来做,甚至于可通过相关蛋白质的结构比对来研究分子进化。以上研究已经积累了大量的工作。

RNA测序和分析RNA测序(RNA-Seq)是一种高通量的方法,可以检测和量化细胞内所有的RNA分子,包括mRNA、miRNA和lncRNA等。生物信息学方法可以对RNA-Seq数据进行比对、拼接、注释和表达量计算等处理,以得到不同基因的表达水平和剪接异构体信息,并进一步研究其生物学功能和调控机制。

氨基酸组成、分子量、等电点、翻译后修饰位点、信号肽、亚定位信号、二级结构、保守结构域、高级结构、相互作用蛋白。软件自己找。

而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究具有非常重要的理论意义和实践意义。

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