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1. 试述如何应用2D-PAGE进行差异蛋白质组学的研究,并分析其优缺点。_百...

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质谱技术MS：是目前分析蛋白质的主要手段之一。质谱技术可以检测蛋白质的质量、序列、修饰和定量等信息，包括基于母离子扫描MS和tandem MS（MS/MS）等多种方法。两维凝胶电泳技术2D-PAGE：是一种基于分子量和等电点对蛋白质进行分离的技术。

转录组学研究的是某个时间点的mRNA总和，可以用芯片，也可以用测序。芯片是用已知的基因探针，测序则有可能发现新的mRNA，蛋白组学针对的是全体蛋白，组要以2D-Gel和质谱为主，分为top-down和bottom-up分析方法。

功能实验 设计功能实验，以深入了解差异表达蛋白在特定生理和病理过程中的作用。在进行这些分析的过程中，保持统计和数据分析的严谨性是关键。实验设计的合理性、样本大小、实验重复、多重比较校正、实验验证等方面都应该得到充分的考虑和处理。

Unlu 等提出了一种荧光差异显示双向电泳（F-2D-DIGE）的定量蛋白质组学分析方法。差异凝胶电泳（DIGE）是对2-DE 在技术上的改进，结合了多重荧光分析的方法，在同一块胶上共同分离多个分别由不同荧光标记的样品，并第一次引入了内标的概念。

生物质谱技术是蛋白质组学研究中最重要的鉴定技术，其基本原理是样品分子离子化后，根据不同离子之间的荷质比（M/E）的差异来分离并确定分子量。对于经过双向电泳分离的目标蛋白质用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg的-C端形成的肽键）成肽段，对这些肽段用质谱进行鉴定与分析。

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