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1. 2019-11-12听课笔记之蛋白质谱的原理及使用(二)

1、2019-11-12听课笔记之蛋白质谱的原理及使用(二)

比如说我们有左上角这样一个肽段，理论上可以得到灰色标记出的各种b-y离子，通过分析质谱图，可以从中找到对应的碎片离子（右边表格里红色标记的都是可以从质谱图中找到的碎片离子），通过将这些信息拼装起来，我们就可以知道多肽的序列是什么。

质谱解析：将带上电荷的肽段送入质谱，肽段会在磁场中发生偏转（质谱仪的基本原理），在质谱里收集信号，得到谱图。 搜库：用搜索软件对质谱图进行自动化的分析，得到肽段及蛋白序列信息。 shotgun一般流程 Tips： 质谱种类很多，比如四级杆质谱、飞行时间质谱、四级杆离子阱、傅里叶变换质谱等。

根据一级质谱可以测得多肽整体的分子量，多肽碎裂时会产生一系列在肽链不同位置断裂而形成的碎片离子，可以得到多肽的二级谱图，根据二级质谱相近谱峰之间的质量数之差可以推算出对应的氨基酸序列。由两个氨基酸分子脱水缩合而成的化合物叫做二肽，同理类推还有三肽、四肽、五肽等。

听课笔记之蛋白质质谱的原理及使用（四） 下图就是色谱离子流图的某个瞬间。横坐标是质荷比，纵坐标是信号强度。这个瞬间进入色谱的有这样一些信号，信号强度最高的是质荷比为4731的肽段，其他一些肽段也可以进行查看。 这是我们在打开质谱的下机数据所能看到的最直观的结果。

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