蛋白质组学参考库-蛋白质组学pdf
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1、国际著名的三大蛋白质数据库
PIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库,可在这里下载。这是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库,其中包括来自几十个完整基因组的蛋白质序列。
常用的蛋白质数据库有很多,其中Uniprot被认为收录最广泛和注释信息最全面的蛋白质数据库。Uniprot下包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD,详见Uniprot_百度百科。其他的蛋白数据库有PDB(Protein Data Bank,简称PDB,开始建立于1971年)等。
DDBJ(DNA Data Bank of Japan):DDBJ是日本的国家生物信息学中心,成立于1986年。DDBJ的主要职责是收集、存储、分析和发布日本的生物数据,包括DNA序列、蛋白质序列、基因组数据等。DDBJ的数据库不仅包含了日本本土的数据,还包含了来自全球各地的数据,其中包括许多重要的科研成果。
蛋白质数据库(Protein Data Bank, PDB)是一个生物大分子,如蛋白质和核酸,的数据库。这些数据包括X光晶体衍射或者NMR核磁共振显示以及由全世界生物学家和生物化学家上传,在网上,它们可以通过PBD的会员组织(PDBe, PDBj, RCSB)免费获取。
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