蛋白质组学高级分析公式-蛋白质组学方法
大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于蛋白质组学高级分析公式的问题,于是小编就整理了1个相关介绍蛋白质组学高级分析公式的解答,让我们一起看看吧。
1、蛋白质的相关计算公式归纳?
(1)蛋白质分子中氨基数=肽链数 R基上的氨基数=各氨基酸中氨基的总数-肽键数;
(2)蛋白质分子中羧基数=肽链数 R基上的羧基数=各氨基酸中羧基的总数-肽键数;
(3)蛋白质分子中N原子数=肽链数 肽键数 R基中N原子数=各氨基酸中N原子的总数;
(4)蛋白质分子中O原子数=肽链数×2 肽键数 R基中O原子数=各氨基酸中O原子的总数-脱水数.
解析:
(1)由于一个肽链中至少有一个游离的氨基,在肽链内部的R基中可能也有氨基,所以蛋白质分子中氨基数=肽链数 R基上的氨基数=各氨基酸中氨基的总数-肽键数;
(2)由于一个肽链中至少有一个游离的羧基,在肽链内部的R基中可能也有羧基,所以蛋白质分子中羧基数=肽链数 R基上的羧基数=各氨基酸中羧基的总数-肽键数;
(3)由于氨基酸在核糖体上通过脱水缩合的方式形成多肽,同时失去水分子,而N原子数没有变化,所以蛋白质分子中N原子数=肽链数 肽键数 R基中N原子数=各氨基酸中N原子的总数;
(4)由于氨基酸在核糖体上通过脱水缩合的方式形成多肽,同时失去水分子,失去的水分子数=肽键数=氨基酸数-肽链数.又一个肽链中至少有一个游离的羧基,因此,蛋白质分子中O原子数=肽链数×2 肽键数 R基中O原子数=各氨基酸中O原子的总数-脱水数.
蛋白质的相关计算公式可以归纳为以下几个方面:
蛋白质中氨基数和羧基数的计算:蛋白质中氨基数等于肽链数加上R基上的氨基数,也等于各氨基酸中氨基的总数减去肽键数。同样,蛋白质中羧基数等于肽链数加上R基上的羧基数,也等于各氨基酸中羧基的总数减去肽键数。在不考虑R基上的氨基数或羧基数时,氨基酸脱水缩合形成的一条多肽链中,至少含有的氨基数或羧基数为1,蛋白质分子由多条肽链构成,则至少含有的氨基数或羧基数等于肽链数。
蛋白质中肽键数及相对分子质量的计算:蛋白质中的肽键数等于脱去的水分子数,也等于氨基酸分子个数减去肽链数。蛋白质的相对分子质量等于氨基酸总质量(氨基酸分子个数乘以氨基酸平均相对分子质量)减去失水量(18乘以脱去的水分子数)。注意:有时还要考虑其他化学变化过程,如二硫键(—S—S—)的形成等,在肽链上出现二硫键时,与二硫键结合的部位要脱去两个H,谨防疏漏。
以上是蛋白质相关计算公式的归纳,希望能对您有所帮助。
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