本篇文章给大家谈谈蛋白质组生物学重复，以及蛋白质组学问题对应的知识点，希望对各位有所帮助，不要忘了收藏本站喔。 今天给各位分享蛋白质组生物学重复的知识，其中也会对蛋白质组学问题进行解释，如果能碰巧解决你现在面临的问题，别忘了关注本站，现在开始吧！

1. 关于TMT/iTRAQ和DIA技术的选择?
2. 饱和d配方最优设计试验需要做生物学重复吗
3. 蛋白组学的结果 生物学重复是必须的吗
4. 蛋白质组学中三次生物学重复只有一次鉴定到的蛋白要怎么处理
5. 【转载】生物学重复与技术重复

1、关于TMT/iTRAQ和DIA技术的选择?

DIA无需指定目标肽段，扫描点数均匀，利用谱图库即可实现定性确证和定量离子筛选，并可实现数据回溯。

其实都是可以的，不过用的最多的都是ESI-itrap，很多trap联用。

如果做iTRAQ（或TMT）标记，最好用TEAB，而不是碳酸氢铵体系。因为iTRAQ（或TMT）试剂是标记末端氨基，碳酸氢铵上的氨基也会被标记上，影响蛋白的标记效率。

技术重复是指对同一生物样品进行重复实验，可降低实验中的测量误差或背景噪音。上机重复是指是指同一样品进行重复上机检测。

蛋白定量检测技术多种多样，按照检测范围可分为靶向与非靶向技术，也可按照定量方式分为相对定量或绝对定量技术。其中，相对定量技术又可分为标记技术（TMT和iTRAQ）和非标记技术（label-free、DIA）。

2、饱和d配方最优设计试验需要做生物学重复吗

生物学重复指的是经过相同方式处理的相同样品。如图所示，对照组A、B、C三只小鼠 （control A， B and C） 互为生物学重复。实验组A、B、C三只小鼠（Treated A）同样互为生物学重复。

在各组处理项目上，通常要用一定数量的试验材料，因此必须有一定数量重复。随试验规模和要求不同，大多每个项目要有4—10瓶，每瓶至少3块培养物或3丛小幼苗。这些材料接入的数量和质量都应细心地尽可能保持一致。

重复设置原则上越多越好，然而考虑到现实条件，重复设置≥3。一般不建议设置两个重复，因为如果两者结果不一致，我们无法确定以哪个数据为参考。注：3个生物学重复，不等同于将3个样品的RNA等量混合后测序。

．重复原则：所谓重复原则，就是在相同试验条件下做多次独立重复试验。一般认为重复5次以上的试验才具有较高的可信度。据本次试验分组，一个处理需要3个重复。4 .弹性原则：所谓弹性，指的是在时间分配图上留有空缺。

3、蛋白组学的结果 生物学重复是必须的吗

蛋白质是所有生命形式和生命活动的主要载体和功能执行者，蛋白质科学既是当代生命科学的前沿，也是生物技术与生物产业发展的重要源泉。

我认为生物学实验的可重复性并不差。当我们纯粹的谈论科学时，几乎一切现象都可以套用因果关系来解释。只要因果关系是成立的，那么实验就应该是可重复的。

WB实验，收样的时候可以不用做复孔，分装蛋白的时候可以分几份跑胶，也可以就跑一次。但是结果至少重复3次（三批的样本）保证重现性。

实验组A、B、C三只小鼠（Treated A）同样互为生物学重复。生物学重复的概念容易与技术重复相混淆。一般来说，技术重复指的是同一样品多次测量。如图所示，任一小鼠在板A、B、C中被重复测量了三次，即技术重复了三次。

人和动物样本因个体特异性较大，建议10个以上生物学重复；肠道、瘤胃或粪便样本因含有较多厌氧菌，要快速取样、迅速低温保存，针对较难富集微生物的样品，如各种物体表面，可采用缓冲液洗脱或棉签擦拭等方法。

4、蛋白质组学中三次生物学重复只有一次鉴定到的蛋白要怎么处理

所得沉淀物用一生中适当的缓冲溶液进行洗涤，洗去可能存在的杂质；用一种适当的试剂将目标蛋白质从配体中离解出来。

四次重复实验检测发现，用这种装置做下来，四次都能被重复的蛋白有99%，只有6%的蛋白是其中任意一次单独鉴定到的，5%是其中两次鉴定到的，0%是其中三次鉴定到的。

此方法可分为：1）利用表面活性剂（三氯乙酸）或有机溶剂引起变性；2）利用对热的不稳定性，加热破坏某些组分，而保存另一些组分；3）酸碱变性。

目前都以3次生物学重复实验设计为主，要求严格的实验可以做5次重复。技术重复：指对同一样本进行重复地检测分析，例如同一份细胞中抽提的蛋白质进行三次质谱检测，或者对同一RNA-seq样本测序3次。

在这个过程中，我们需要用剪刀和镊子剥离血管组织和脂肪组织等，这些组织的存在会对我们对样品，比如肝脏组织的蛋白质类型产生干扰。去血的过程中同时需要加入蛋白酶抑制剂。

5、【转载】生物学重复与技术重复

与生物学重复相比，技术重复的测量变异程度较小，从而可以减少实验中的分析变异，将对同一份样本产生高重复性的测量结果 。简单来讲，生物重复是生物级别的重复，一般都是生物样本的重复。

生物学重复是指不同生物个体或者不同生物群体的样品之间进行地相同处理而进行的实验，而技术重复是指同一样品进行的多次相同实验。生物学重复指的是经过相同方式处理的相同样品。

由于抽提具有可重复的特点， 与生物学重复相比， 技术重复的测量变异程度较小。但是技术重复不是完全独立的，取平均值不能去除共有的系统偏差（Yang and Speed， 2002）。

Replication这篇文章以测定小鼠肝脏细胞中的某一个gene的表达量为例，展示了什么是生物学重复和技术重复以及如何权衡这两者之间的关系。

如何来设定转录组测序中的生物学重复 区分生物学重复与技术重复 生物学重复：指样本重复，比如3只小鼠，同时做一种处理，就是三个生物学重复。

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