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单细胞分离黑暗-单细胞分离黑暗的原因

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  1. 单细胞解离那些事

1、单细胞解离那些事

构成组织的细胞相互分离为游离的单细胞(胞间组织被破坏)2,细胞死亡程序。如果你是高中生,你的问题来源是“观察细胞有丝分裂”那个试验,那就是第一种意思。

细胞解离过程主要存在两个难点:(i)如何避免外在刺激对细胞转录产生影响。细胞内部存在早期反应基因(Early response genes)能够对外界刺激做出快速反应,因此解离过程中可能会发生细胞转录的变化。

样本制备(分离细胞) 单细胞RNA测序的一般实验工作流程始于将感兴趣的器官或组织解离。充分的样本准备是产生良好的单细胞转录组数据的先决条件。

scRNA-seq数据中的低质量文库可能有多种来源,例如解离过程中的细胞损伤或文库制备失败(例如无效的逆转录或PCR扩增)。这些通常表现为总计数低,表达的基因很少,线粒体或spike-in比例高的“细胞”。

美天旎组织保存液适用于多个时间点采样/不能及时处理样本时48h内的组织保存,不仅细胞得率高,而且活性强。实际上组织样本在保存液中存放一天后解离的效果和活性,包括后期单细胞测序数据所呈现的结果都具有很高的重复性。

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