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1. 如何用DNAMAN画载体图

1、如何用DNAMAN画载体图

一般常用的序列比对软件有DNAMAN和Chromas，当然，还有很多类似软件，大家可以根据个人习惯选择，在这里就不一一介绍了。

在创口上部菜单栏中找到有search 功能的按键，会弹出一个小文本框窗口，输入你的引物序列，然后让它寻找（search）。但是要注意引物有正义链与反义链输入的区别。不知道你的引物是普通的25个碱基，还是30个碱基以上的超长引物。后者引物可以用alignment（比对）试试。不过也要注意正义、反义链的输入。

测序得到基因序列后一般都需要进行序列比对，看和目的序列的差异情况，常用的软件有DNAman，还有invitrogen的vectorVI也不错。此外还可以直接在网上进行比对，推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行。克隆至质粒载体中后集中测序〔9，10〕。

如果你的序列同源性不高，GC含量也还可以的话，可以使用一些经验性原则。引物最好在模板cDNA的保守区内设计。 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因，通过序列分析软件（比如DNAman）比对（Alignment），各基因相同的序列就是该基因的保守区。

第一步是将预先连接在固相载体CPG上的活性基团被保护的核苷酸与三氯乙酸反应，脱去其5′-羟基的保护基团DMT，获得游离的5′-羟基。

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