构建位点突变载体-突变位点引物设计
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1、同源敲除突变体的构建方法
实现基因敲除的多种原理和方法:利用基因同源重组进行基因敲除基因敲除是80年代后半期应用DNA同源重组原理发展起来的。
依靠一个复合物,该复合物能在一段RNA指导下,定向寻找目标DNA序列,然后将该序列进行切除。
去除原核生物细胞、真核生物的生殖细胞、体细胞或干细胞基因组中的基因等。广义的基因敲除包括某个或某些基因的完全敲除、部分敲除、基因调控序列的敲除以及成段基因组序列的敲除。常用同源重组的方法。
并引导Cas9核酸内切酶对靶序列的PAM上游进行切割。从而造成靶位点DNA双链断裂,随之利用细胞的非同源末端连接(NHEJ)或同源重组(HDR)的方式对切割位点进行修复,实现DNA水平的敲除、敲入或点突变。
同源重组:通过设计同源重组,可以在果蝇基因组中引入精确的突变。这种方法通常使用转座子或人工设计的同源序列来进行重组。基因编辑技术:近年来,基因编辑技术如CRISPR-Cas9在果蝇突变体的研究中得到了广泛应用。
2、如何构建载体
②利用他在宿主细胞内对目的基因进行大量的复制(称为克隆)。理想的运载体是质粒(plasmid),在基因工程中,常用人工构建的质粒作为载体。
选择合适的载体:根据实验目的和需要,选择适合的载体。常用的载体有质粒、噬菌体、病毒等。 设计引物:根据目标基因的序列,设计合适的引物。引物的设计需要考虑其特异性、长度、GC含量等因素。
首先要用一定的限制酶切割质粒,使质粒出现一个缺口,露出黏性末端。用同一种限制酶切断目的基因,使其产生相同的黏性末端。
载体构建的方法:将外源DNA片段与线性化的质粒进行连接,形成重组质粒。使用适当的转化方法将构建好的质粒转化到目标细胞中,使其能够进入细胞内。
“酶切-连接”方法是通常构建RNA干扰载体最常用的方法,被广泛应用于各种生物之中。其构建过程是:通过PCR方法得到目的基因的片段(添加了合适的酶切位点),使之正反相连形成顺式片段和反式片段。
3、我要构建启动子上含有转录因子结合位点突变序列的荧光素酶报告载体...
用生物信息学方法分析并预测启动子区可能的转录因子结合位点。(2)设计引物用PCR法从基因组DNA中克隆所需的靶启动子片段,将此片段插入到荧光素酶报告基因质粒(pGL3-basic)中。(3)筛选阳性克隆,测序。
构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,如pGL3-basic等。(2) 将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系。
通常荧光素酶的实验会将待检测的调控元件(启动子)安排在荧光素酶基因的上游,构建成载体,然后将构建完成的载体导入到合适的动物细胞中,通过检测荧光素酶的活性来判断调控元件的活性。
一般是在启动子的上游区域,不同的启动子有不同的转录因子结合序列。基因转录有正调控和负调控之分。
4、如何通过构建突变载体的方法使细胞内基因低表达
转录水平调控:转录起始、延伸、终止均有影响。原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作用元件和反式作用因子相互作用进行调控。转录后水平调控:真核生物原初转录产物经过加工成为成熟的mRNA,包括加帽、加尾、甲基化修饰等。
knock-out(基因敲除)。这是从基因组水平上进行的,基因内部插入一段较长的DNA序列,或是人为使基因的序列改变,采用的实验方法可以使用基因打靶或者是T-DNA插入。
如果是的话,建议你将该基因的启动子和CDS序列分开放在两个载体上,这样就不会表达了。然后你将两个载体发送给你的客户,他们要用CDS就用CDS,要用启动子就用启动子,两个都要自己做个酶切连接即可,就省去很多麻烦了。
另一个方法是用报告基因重组子来监控miRNA的抑制。miRNA会抑制报告基因的表达,除非它的活性受阻。当然,这种报告基因的使用一般受限于细胞培养环境。
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