构建载体需要utr吗(构建载体容易出现的问题)
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1、导入载体之后的目的片段与原片段发生两个碱基的差异,是什么原因_百度知 ...
构建表达载体时目的片段可以携带utr区的碱基首先要用一定的限制酶切割质粒,使质粒出现一个缺口,露出黏性末端。然后用同一种限制酶切断目的基因,使其产生相同的黏性末端(部分限制性内切酶可切割出平末端,拥有相同效果)。
有可能是在PCR扩增目的片段时,由于未采用高保真DNA聚合酶,导致的碱基突变。也可能是PCR扩增目的片段时,设计的引物特异性不高,或反应体系及参数对特异性控制的不好,获得的是非目的条带。
这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。
后随链合成的不连续冈崎片段用DNA连接酶连接复制到达复制终止序列,在终止蛋白作用下终止复制。
这样损伤就限制在原来的链上,不至影响到新合成的DNA。在一个具有切除修复缺陷的E.coli中,RecA基因的突变使其失去所有的修复能力,人们试图在Uvr-/RecA-的细胞中进行复制产生一段DNA片段,预期其长度是在两个TT之间。
2、LncRNA 过表达慢病毒载体引物设计
构建 lncRNA 过表达质粒或者慢病毒、腺病毒包装载体。原则上是将全长lncRNA 定向克隆到表达载体上实现 lncRNA 的过表达。然而有些 lncRNA很大或全长尚未分离,这时将视 lncRNA 在基因组上的定位采取不同的研究策略。
第一次PCR:F R1 cDNA→A,F1 R cDNA→B;因为F和R端是全长的两端。因此需要设计出所需要的酶切位点 ,这个可以根据自己的载体来确定。
下面我们以lncRNA PVT1的克隆和表达,分别采用T/A克隆,传统酶切-酶连克隆和无缝克隆进行示例。(1) T/A克隆 T/A克隆是把PCR片段与一个具有3’-T突出的载体DNA连接起来的方法(图15)。
3、载体构建系列疑问。。、。
构建载体时,转化过后不长菌的原因:转化的时候有误,可以重新实验。
SmaI酶切体系是否正确?通常酶量不能超过体系1/10,否则甘油会妨碍酶切的进行。
可能是太弱你看不出来,建议用His抗体做个western 看看是不是有条带而看不出。2 是不是融解性太差,建议将你的氨基酸序列做个疏水性分析。
每个基因都带有启动子和终止子。提取的目的基因本身就带有启动子和终止子,如果是通过逆转录方法合成的目的基因,就要先人工加上启动子和终止子,再进行扩增。
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