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载体构建验证lncrna功能-载体构建步骤

载体构建验证lncrna功能-载体构建步骤

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  1. LncRNA 过表达慢病毒载体引物设计
  2. 用什么方法证明蛋白质和lncrna的相互作用
  3. 如何过表达long non-coding RNA?用哪些载体

1、LncRNA 过表达慢病毒载体引物设计

构建 lncRNA 过表达质粒或者慢病毒、腺病毒包装载体。原则上是将全长lncRNA 定向克隆到表达载体上实现 lncRNA 的过表达。然而有些 lncRNA很大或全长尚未分离,这时将视 lncRNA 在基因组上的定位采取不同的研究策略。

第一次PCR:F R1 cDNA→A,F1 R cDNA→B;因为F和R端是全长的两端。因此需要设计出所需要的酶切位点 ,这个可以根据自己的载体来确定。

下面我们以lncRNA PVT1的克隆和表达,分别采用T/A克隆,传统酶切-酶连克隆和无缝克隆进行示例。(1) T/A克隆 T/A克隆是把PCR片段与一个具有3’-T突出的载体DNA连接起来的方法(图15)。

2、用什么方法证明蛋白质和lncrna的相互作用

体外检测蛋白质与蛋白质之间相互作用,用于验证 两个已知蛋白的相互作用 ,或者 筛选与已知蛋白相互作用的未知蛋白 。

研究DNA-蛋白质相互作用的实验方法主要包括:a、凝胶阻滞实验; b、DNase 1 足迹实验;c、甲基化干扰实验; d、体内足迹实验; f、拉下实验。

这个方法的优势在于廉价且易操作,这个方法一度非常流行,既可以用于筛选目标基因的相互作用蛋白,也可以用于验证相互作用,以及定量检测相互作用的强度。

利用抗体专一性特征,检测蛋白质-蛋白质相互作用。染色质免疫共沉淀 研究蛋白质与核酸相互结合的技术。甲醛固定时,相互靠近的蛋白与蛋白,蛋白与核酸(DNA或RNA)之间会产生共价键。

3、如何过表达long non-coding RNA?用哪些载体

因此,必须用一种特殊的RNA——转移RNA(transferRNA,tRNA)把氨基酸搬运到核糖体上,tRNA能根据mRNA的遗传密码依次准确地将它携带的氨基酸连结起来形成多肽链。每种氨基酸可与1-4种tRNA相结合,已知的tRNA的种类在40种以上。

基因表达产物通常是蛋白质,但是非蛋白质编码基因如转移RNA(tRNA)或小核RNA(snRNA)基因的表达产物是功能性RNA。

基因过表达的步骤是:1,构建克隆。将目的基因连接在特定的载体上,载体种类依据表达系统差异而不同。在载体上一般含有增强基因转录的promoter,不同系统中采用的promoter完全不同 2,将克隆导入表达细胞中。

构建 lncRNA 过表达质粒或者慢病毒、腺病毒包装载体。原则上是将全长lncRNA 定向克隆到表达载体上实现 lncRNA 的过表达。然而有些 lncRNA很大或全长尚未分离,这时将视 lncRNA 在基因组上的定位采取不同的研究策略。

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