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载体构建后菌落pcr做不出来,菌落pcr有条带但菌液摇不出来

载体构建后菌落pcr做不出来,菌落pcr有条带但菌液摇不出来

大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于载体构建后菌落pcr做不出来的问题,于是小编就整理了4个相关介绍载体构建后菌落pcr做不出来的解答,让我们一起看看吧。

  1. 为什么基因链接好做完转化之后长出来的菌落做PCR验证没有结果呢,扩增不...
  2. 菌落pcr跑不出来
  3. ...子载体遇到了困难,总出现假阳性的克隆,菌液PCR检测不到目的片段却...
  4. 请教各位前辈 为什么我做菌落PCR总也P不出来

1、为什么基因链接好做完转化之后长出来的菌落做PCR验证没有结果呢,扩增不...

如果你确认 “转化后挑取含有目的片段的单菌落”这个步骤正确的话,就是你的PCR出问题了么,继续扩增便可。目的片段与载体脱离还是保留的菌种失活? 应该都不会。

而PCR扩增对模板的量也是有一个比较合适范围的,你可以分别用师兄师姐给的确定能P出来的质粒和基因组DNA,按照他们的经验给的最适模板量,在最适模板量上下设置一个梯度范围去扩增,找到自己认为的最适模板浓度。

细胞都不知道杀死没 :rol:一般大肠杆菌用菌液PCR都很不稳定的 你想P的基因不会在基因组里吧?就算在质粒里也不一定能P出来 何况基因组。

菌落pcr的假阳性很多,也有很多原因,所以一般都是需要测序结果佐证的。1,引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行 PCR 扩增时,扩增出的 PCR 产物为非目的性的序列。

菌落PCR的假阳性高很可能是因为你做PCR的循环数过大,我们实验室一般对于高拷贝数的质粒,循环数不会超过25个,一般用25个。

2、菌落pcr跑不出来

可能是因为你的DNA产物与酶进行结合了,导致堵在胶孔里跑不下来,你可以加一点SDS然后再跑胶图,就可以分开了,就不会堵在胶孔里了。

你这个方案存在3个可能的问题:PCR体系有问题;磁珠拉菌拉不下来;磁珠会破坏PCR体系。个人感觉应该不会是磁珠,毕竟通过离心或者磁铁吸引的方式可以很轻松的分离磁珠,而且机制来说也说不清楚。

原因有PCR体系问题、引物问题、模板质量问题。PCR体系问题:检查PCR体系有没有问题,也就是试剂有没有问题,比如扩其他的基因能不能扩出来。

因为在紫外灯下可以看到明显的后移条带。我是扩增16srDNA我们实验室以前都是用菌落PCR的,能扩增出来,可我就是扩不出来,郁闷!老大,再给指教指教吧!王会征(站内联系TA)建议提质粒进行PCR,菌落PCR很不准的。

3、...子载体遇到了困难,总出现假阳性的克隆,菌液PCR检测不到目的片段却...

我想这是因为你的启动子检测载体设计的不合理造成的,你可以在启动子前而加一个转录终止子,以阻止这种假阳性信号。还有一个原因是:如果是原核生物,启动子本来就只有几十甚至十几个bp,PCR检测不到很正常。

引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行 PCR 扩增时,扩增出的 PCR 产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。

如果positive control有条带,但是你的目的条带没有,就说明你的克隆都是阴性的。你体系中加DMSO,是因为目的片段的GC含量较高吗?这种片段本身就比较难扩增。

如果PCR系统没有问题,很可能是质粒和染色体发生了重组。建议提细菌的genome DNA 做一次PCR。如果是阳性,就说明是这样。另外,还可以另挑几个菌落,重新提质粒扩增。

4、请教各位前辈 为什么我做菌落PCR总也P不出来

此外,检查你的平板是不是太长时间了,抗生素失效?会造成质粒丢失,自然p不出来。

新划板革兰氏阴性菌一般PCR是可以P出条带的,不过挑菌体挑多了也会P不出来!天龙n部(站内联系TA)我们好像很好P啊,你不会没连上目的基因吧丰之第(站内联系TA)你可能是把培养基挑在里面了。建议先处理,后pcr。

菌落PCR的假阳性高很可能是因为你做PCR的循环数过大,我们实验室一般对于高拷贝数的质粒,循环数不会超过25个,一般用25个。

你用菌斑跑PCR是能跑出,很可能因为转化农杆菌用的质粒较多,使得培养基和细菌表面都有很多没转进去的目的质粒,可以作为模板,扩出目的带,而用菌液时,细菌表面的质粒已被稀释了很多倍,所以P不出来,或者带很弱。

到此,以上就是小编对于载体构建后菌落pcr做不出来的问题就介绍到这了,希望介绍关于载体构建后菌落pcr做不出来的4点解答对大家有用。

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