载体构建酶切位点选择(pmd19t载体酶切位点)
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1、PET-29A载体中酶切位点怎么选择
看你要插入的序列片段张是否有相同的酶切位点。
AMP是可以插入的,方法有很多,比如酶切,比如overlapping PCR,不过还是建议用卡那霉素筛选,蓝白斑也可以的。有lacI可以弄蓝白斑的。
酶切位点的选择一定是要避开目标片段内包含的位点,因为如果不避开到时候酶切就会把目的片段切开。在目的片段和载体之间的酶切位点都是扩增引物带入的。
可以通过PCR技术对载体上的一个酶切位点进行定点突变,即可达到目的。
酶切位点需要存在于MCS中,但同时不能存在于目的基因序列中。两个酶切位点之间至少要有几个碱基间隔,不能紧邻或重叠。最好选择成熟的内切酶。
2、载体构建酶切位点的问题
酶切位点的距离太小(小于10bp),影响限制性内切酶对切点的识别,不利于空载体的双酶切。
IN-FUSION克隆技术的缺点:载体和基因内部酶切位点的局限性、非特异性扩增的可能性、长片段连接效果差、大规模载体构建困难。
不同酶切位点所需要的保护碱基是不一样的,一般参考NEB网站上的一个保护碱基表。一搜就有了。如果不做PCR产物酶切而是直接连接T载体,就可以不加保护碱基,PCR结束后直接加A连T,然后按流程操作就可以了。
酶切位点有些基因里面有,有些基因里面没有,不一定的。现在基因工程里面,利用酶切位点可以方便地把基因切下来装上去,以此来改造质粒载体。所以质粒载体上都会故意留着酶切位点,或者在基因两端人为地加上酶切位点。
这是重组DNA实验中常采用的一种筛选重组体的方法:在四环素抗性基因中有一个酶切位点,那么外源的DNA一旦插入到这个位点上。
3、bamh1酶切位点是什么
bamh1酶切位点如下:在分子克隆实验中,限制性内切酶是必不可少的工具酶。 无论是构建克隆载体还是表达载体,要根据载体选择合适的内切酶(当然,使用T载就不必考虑了)。先将引物设计好,然后添加酶切识别序列到引物5; 端。
本身功能和结构上没有变化,区别在多克隆位点198位的BamH1酶切位点,pET21a比b多了一个碱基。产生的差异在于在考虑用BamH1的同尾酶构建载体是有区别的,细节的地方你自己再看看吧。
Bamh1的酶切时间是 2-3小时。Bamh1是一种限制性内切酶。
④ 分析载体质粒的酶切位点,这里用pLvx-puro作为目的基因的载体 因此,BamHEcoR1不可使用,其他可用的有:XhoBsyBApal、Smal、Xbal 酶切的选择还需要考虑现实情况,我们组内有现货的酶: Xho1, Xbal。
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