构建质粒载体酶切位点-质粒的酶切位点怎么选择
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- 构建质粒载体中用PCR获得目的基因,其中涉及的引物为什么要加酶切位...
- 构建重组表达质粒前,还需要将空表达载体和重组克隆质粒进行双酶切...
- 质粒作为基因工程中的运载体必须要有2个以上的限制酶的切点吗?
- 在质粒载体中无法找到与目的DNA符合的酶切位点,如何解决
- 构建重组载体时用两种限制酶切割目的基因的原因
1、构建质粒载体中用PCR获得目的基因,其中涉及的引物为什么要加酶切位...
加酶切位点的目的是方便进行下面的克隆;如果你只是用于PCR鉴定等,添加酶切位点反而不好。
在设计pcr引物时,会将酶切位点设计在引物里面,但是pcr后的片段是双链平末端,需要将设计的酶切位点粘性末端暴露出来,所以需要酶切处理。
做为具有使用性的载体,一般最少有2个以上不同的限制性酶切位点,这样能够保证需要插入片段的效率和插入的片段插入的方向性。
提质粒的目的是去除 RNA,将质粒与细菌基因组 DNA分开,去除蛋白质及其它杂质,以得到相对纯净的质粒。酶切的目的是对粘末端的DNA分子和载体分子进行切割,以获得相应的粘末端连接。酶切可以是单酶切也可以是双酶切。
2、构建重组表达质粒前,还需要将空表达载体和重组克隆质粒进行双酶切...
双酶切就是为了验证是否有目的基因,如果双酶切条带正确,而且PCR也没有问题,就可以确定质粒构建成功。质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆较小的DNA片段(10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。
构建重组质粒时并不是只用同种限制酶切割目的基因和载体,虽然理论上本应如此,一般都用同种才会容易处理,但常见的也有将两种限制性内切酶,也就是不同的限制酶进行双酶切,最后也会产生互补的黏性末端。
将一个目的基因连接到质粒上,一般用两种DNA内切酶做双酶切,使目的基因和被切开的质粒片段两端都有特异性的粘性末端,然后用DNA连接酶把目的基因与质粒片段连起来。
先通过双酶切反应酶切空质粒载体和目的基因,再通过酶连反应连接空质粒载体和目的基因,从而构建成完整的重组质粒。此时重组质粒的T-DNA区包括T-DNA边界序列、复制原点、突变启动子片段、GUS报告基因、抗性基因。
\验证重组质粒的构建是否成功,如果成功了,电泳应该是载体片断和插入序列两条条带,分别对应应有的长度。
3、质粒作为基因工程中的运载体必须要有2个以上的限制酶的切点吗?
做为具有使用性的载体,一般最少有2个以上不同的限制性酶切位点,这样能够保证需要插入片段的效率和插入的片段插入的方向性。
有多个限制酶切点是说能与多种限制酶反应,但每种酶切点只有一个是位置与特定的限制酶反应,这样使的质粒基因不会丢失,且对质粒上其他的基因功能减少影响。
做为具有使用性的载体做为具有使用性的载体,一般最少有2个以上不同的限制性酶切位点,这样能够保证需要插入片段的效率和插入的片段插入的方向性。
有多个限制酶(Restriction enzymes)切点,而且每种酶的切点最好只有一个,如大肠杆菌pBR322就有多种限制酶的单一识别位点,可适于多种限制酶切割的DNA插入。
4、在质粒载体中无法找到与目的DNA符合的酶切位点,如何解决
这是重组DNA实验中常采用的一种筛选重组体的方法:在四环素抗性基因中有一个酶切位点,那么外源的DNA一旦插入到这个位点上。
重组时选择你的目的基因上没有,而质粒的多克隆位点上有的酶切位点,一般重组质粒需要两个酶,所以你要选择两个酶切位点,注意尽量避免使用切出平末端的酶。
转不进细胞,少量没有切开的空载体转进细胞,形成阴性菌落。
载体DNA必需有一个或多个限制酶的切割位点,以便目的基因可以插入到载体上去。这些供目的基因插入的限制酶的切点所处的位置,还必须是在质粒本身需要的基因片段之外,这样才不至于因目的基因的插入而失活。
5、构建重组载体时用两种限制酶切割目的基因的原因
为了防止目的基因和运载体自身环化。为保证目的基因正序插入运载体,防止反向连接。限制性核酸内切酶是可以识别并附着特定的脱氧核苷酸序列,并对每条链中特定部位的两个脱氧核糖核苷酸之间的磷酸二酯键进行切割的一类酶。
双酶切就是为了验证是否有目的基因,如果双酶切条带正确,而且PCR也没有问题,就可以确定质粒构建成功。质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆较小的DNA片段(10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。
用不同限制酶切割的目的是:保证目的基因和质粒(运载体)的准确连接,避免无效连接过多。
构建重组质粒时并不是只用同种限制酶切割目的基因和载体,虽然理论上本应如此,一般都用同种才会容易处理,但常见的也有将两种限制性内切酶,也就是不同的限制酶进行双酶切,最后也会产生互补的黏性末端。
有两个方面,一是载体本身酶切不充分,没有完全切开;二是去磷酸化不充分。
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