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怎么构建噬菌体单链载体-噬菌体载体的构建

怎么构建噬菌体单链载体-噬菌体载体的构建

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  1. 描述M13丝状单链噬菌体克隆载体的应用步骤?
  2. M13噬菌体的构建
  3. 噬菌体展示文库构建流程是什么样的?

1、描述M13丝状单链噬菌体克隆载体的应用步骤?

【答案】:可用M13载体进行单链【)NA的克隆。具体步骤包括单链DNA模板的制备、载体DNA的制备、体外连接与包装、重组噬菌体感染大肠杆菌、单链DNA克隆的鉴定与扩增等。

步骤:DNA片段的制备、载体的选择、片段与载体连接。在分子水平上提供一种纯化和扩增特定DNA片段的方法。

载体的插入位点在 M13 噬菌体基因组中绝大多数为必需基因,只有两个间隔区可用来插入外源 DNA(基因 Ⅱ/Ⅳ 和基因 Ⅷ/Ⅲ 之间)。基因 Ⅱ 和基因 Ⅳ 之间的 508bp 间隔区是主要的外源片段插入位点。

【答案】:①将待突变基因克隆到突变载体(M13噬菌体DNA)上。②导入具有dUTP酶(dut)和尿嘧啶-N-糖基化酶(ung)双缺陷的大肠杆菌菌株中培养,制备含U的单链模板DNA。

2、M13噬菌体的构建

【答案】:M13噬菌体载体是基于大肠杆菌M13丝状噬菌体基因组构建的载体,在M13噬菌体基因组基因间隔区中插入β-半乳糖苷酶N端一小段编码序列(内插入若干限制性内切酶的单一切点)及其调控序列。

DNA片段制备:将目标基因片段进行PCR扩增,引入所需的限制酶切位点。根据需要,选择合适的载体进行克隆。常用的载体包括噬菌体M1pComb3X等。构建噬菌体文库:将目标基因片段与载体进行连接,产生融合蛋白编码DNA。

插入DNA序列:首先需要将待克隆的DNA片段插入到M13载体的多克隆位点(Multiple Cloning Site, MCS)中。这可以通过限制性内切酶切割目标DNA和载体DNA,利用DNA连接酶将两者连接起来完成。

M13 噬菌体的基因组为单链 DNA ( DNA),由 6407 的碱基组成。基因组 90% 以上的序列可编码蛋白质,共有 11 个编码基因,基因之间的间隔区多为几个碱基。

噬菌体载体有λ噬菌体载体和丝状噬菌体载体。以λ噬菌体载体为基础构建的常用载体分为:替换型载体和插入型载体。丝状噬菌体载体包括M13噬菌体和 f 噬菌体。

3、噬菌体展示文库构建流程是什么样的?

应用噬菌体展示技术的关键是构建表达性基因文库,这种文库称为噬菌体展示文库(phage display library )。常用的构建噬菌体显示文库的表达载体有两类:丝状噬菌体和以这些噬菌体复制起始序列为基础构建的噬菌粒(phagemid)。

其基本步骤包括:RNA 的提取(例如异硫氰酸胍法,盐酸胍—有机溶剂法,热酚法等等,提取方法的选择主要根据不同的样品而定),要构建一个高质量的 cDNA 文库,获得高质量的 mRNA 是至关重要的,所以处理 mRNA 样品时必须仔细小心。

在构建基因文库时,不同的重组噬菌体DNA经过裂解生长过程最终形成大量的噬菌斑,这些噬菌斑的集合,就构成了基因文库,用λ噬菌体载体构建基因文库时,文库是以噬菌斑的形式存在的,而质粒载体构建的文库是以菌落的形式存在的。

在展示文库构建完成后,以靶蛋白为固定相,和展示文库共同孵育一段时间,洗去未结合噬菌体,再以竞争受体洗脱吸附的噬菌体。洗脱得到的噬菌体感染宿主菌繁殖扩增,然后进行下一轮洗脱。

单链丝状噬菌体展示系统(1)PⅢ展示系统。丝状噬菌体是单链DNA病毒,PⅢ是病毒的次要外壳蛋白,位于病毒颗粒的尾端,是噬菌体感染大肠埃希菌所必须的。

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