载体构建酶切跑胶无条带,载体的酶切
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1、慢切载体跑胶没有条带
我觉得不需要另外转入空载,PMD18-T vector的连接率挺高的。只要挑取阳性克隆抽质粒,经酶切、PCR后有目的条带就可以拿去测序了。
如果检测胶可以看到条带,回收胶看不到的话,可能是你PCR的产物的量太少了,回收胶胶孔宽,PCR结果不好的条带可能就看不到了。
一般是不要切胶,直接把第一次的pcr产物取一微升作为底物,再用第二队引物扩增一次,如果引物设计正确,就只会出现一条条带了。如果要计算大小,就按楼上说的。但是雀式pcr的目的就是至少做2次,以保证特异性。
建议用新胶,新tbc(tac)重新跑一次,样品用醋酸铵重新纯化,电泳槽用缓冲液冲洗多次再用。另外可以在电泳槽周围放冰,降低电泳温度,并适当调低电压,因为高温对核酸降解也有促进作用。
2、为什么基因与载体连接后直接泡胶但是什么条带都没有
“单酶切可以切开,而且质粒的大小明显小于空质粒”,首先你的表达有误,单酶切可以切开,说明目的基因有连接上,那么重组载体该是比空载大的。质粒稀释100倍后PCR,有目的条带,也说明了是阳性克隆。
如果检测胶可以看到条带,回收胶看不到的话,可能是你PCR的产物的量太少了,回收胶胶孔宽,PCR结果不好的条带可能就看不到了。
紧接着,又做了一次,所有的样品都有PCR产物了。
很显然你的质粒没有构建成功。感觉是连接出了问题,pBI121载体很大,回收比较困难,建议你测一下回收后的浓度。如果太低的话,建议加大酶切量。
所以整团DNA样品漂在上面。2)没有MARKER,请确定你的胶是否加了足够量的EB或是别的染色剂。另外请检查电泳开始后,电泳槽两侧是否有气泡冒出,如果没有,证明电泳仪坏了,没有通电,那么肯定不会出现条带。
3、为什么酶切后没有条带
建议可以用分光光度计测一下核酸浓度,看看是不是浓度太低。同时可以做一个阴性对照,就是不加酶,1ul质粒,20ul体系,看看最后有没有质粒条带。这样可以检测制胶、核酸浓度等的其他原因。
如果是有质粒条带而没有短片段条带,也就是说没切开了。可能酶切位点发生了突变,也可能是酶失活了。如果是空白...我也不知道怎么回事儿了...再重复一次吧。如果认为之前的步骤都没什么问题,不如直接送测序。
可能其中一个酶质粒上有2个酶切位点,或是因为酶切不彻底,部分质粒没有被双酶切(大片段,小片段,和单酶切得出的片段,因片段大小不一呈现出三条带)。
如果酶切前有DNA条带,而酶切后没有,很可能是激发了限制酶的星号活性,把DNA切碎了。
4、载体酶切切不出条带是怎么回事?
双酶切质粒或的一条带很正常的,因为多克隆区域切下来的那个小片段太少(总碱基mol量),电泳常常是看不到的,这是常见现象。一条带都没有 不正常。估计是电泳时间不够吧。
如果理论上:用用sacⅡ单酶后能出现你的目的条带,但实际上没有酶切出目的条带(t载体有),我认为原因是T载体自连,你的目的条带没有连上!建议重连,并用菌落PCR检验,然后用酶切检验。
凝胶浓度是不是太大了使marker(相当于阳性对照)的大条带都跑不开。建议可以用分光光度计测一下核酸浓度,看看是不是浓度太低。同时可以做一个阴性对照,就是不加酶,1ul质粒,20ul体系,看看最后有没有质粒条带。
⑤模 板核酸变性不彻底。在酶和引物质量好时,不出现扩增带,极有可能是标本的消化处 理,模板核酸提取过程出了毛病,因而要配制有效而稳定的消化处理液,其程序亦应 固定不宜随意更改。
5、构建载体,双酶切质粒后,不是只有一条质粒带就是一条带都没有,寻是什 ...
可能其中一个酶质粒上有2个酶切位点,或是因为酶切不彻底,部分质粒没有被双酶切(大片段,小片段,和单酶切得出的片段,因片段大小不一呈现出三条带)。
补充一点就是看看你的片段是否有这个酶的酶切位点。尽管有些好笑,但是有人确实犯过这样的错误。你提取的质粒浓度很低的话,在酶切的时候就少加点水多加点质粒。不然浓度低当然看不见。
如果是单酶切,超螺旋质粒会变成开链DNA,开链的DNA在凝胶中泳动速度慢于超螺旋质粒,因此条带会偏大,这是酶切充分的情况。
一条带就对了,要是没切开会有好几条带的,双酶切后的小片段太短了,只有大片段的百分之几,所以亮度也只有大片段的百分之几,仪器的灵敏度也是有限的,就像肉眼看不到细菌一样,看不到不表示不存在啊。
电泳缓冲液是不是新配的啊?Marker都有问题的话,提质粒,酶切应该没问题。
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