构建siRNA表达载体-sirna质粒载体构建
大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于构建siRNA表达载体的问题,于是小编就整理了4个相关介绍构建siRNA表达载体的解答,让我们一起看看吧。
1、...利用RNAi技术研究该基因的功能?RNAi载体怎么构建?
“酶切-连接”方法是通常构建RNA干扰载体最常用的方法,被广泛应用于各种生物之中。其构建过程是:通过PCR方法得到目的基因的片段(添加了合适的酶切位点),使之正反相连形成顺式片段和反式片段。
RNAi是一种高效的特异性强的基因阻断技术。可以快速分析靶基因的功能,RNAi发展迅速,已成为功能基因组研究和反向遗传学研究的有力工具。RNAi技术被《Science》杂志评为2002年度的十大科技突破。
rnai技术的基本程序主要为:确定干扰靶点、合成siRNA、转染siRNA到细胞中。确定干扰靶点:通过基因组学凳厅袜、转录组学等手段,确定需要干扰的靶基因或RNA。
RNAi是有dsRNA参与指导的,以外源和内源mRNA为降解目标的转基因沉默现象。具有核苷酸序列特异性的自我防御机制,是一种当外源基因导入或病毒入侵后,细胞中与转基因或入侵病毒RNA同源的基因发生共同基因沉默的现象。
在水稻中利用RNAi技术来验证定位的基因 。如根据定位的矮秆或多蘖基因所在的BAC设计引物 ,获得小片段cDNA ,再将其连到载体中通过农杆菌介导法导入正常的植物体内 ,让其在植物体内表达 。
2、什么是siRNA表达框架?
siRNA表达框架方法的主要缺点是:①PCR产物很难转染到细胞中(晶赛公司的Protocol可以解决这一问题);②不能进行序列测定,PCR和DNA合成时可能差生的误读不能被发现导致结果不理想。
siRNA即小干扰RNA(Small interfering RNA),是一类长度为21-25 bp的双链RNA(dsRNA)分子,广泛用于RNA干扰技术,是高效特异的基因缺失性研究工具。
具有很高的稳定性。2. 相同的sRNA在不同细胞、不同组织器官以及不同种属之间具有相似的序列以及调控功能。3. sRNA在不同组织、不同细胞间的表达谱表现特征不同,因此sRNA表达谱可以作为某些组织或细胞的特异性分子标志。
miRNA,siRNA,shRNA的区别在于:miRNA的主要功能是下调基因的表达;siRNA其主要在RNAi通路中起作用,干扰特异基因的表达;shRNA常被用于RNA干扰沉默靶基因的表达。
siRNA(全写:SmallinterferingRNA)是一种小RNA分子(约21-25核苷酸),由Dicer(RNAaseⅢ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成,SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。
3、构建植物siRNA有哪些表达载体?
体内转录:最近有几个研究小组构建了一些可以在真核细胞内表达siRNA的载体,包括被广泛应用的质粒载体和新研发的转染效率较高的病毒载体。
siRNA表达框架:siRNA表达框架(siRNA:expression:cassettes,SECs)是一种由PCR得到的siRNA表达模版,包括一个RNA:polⅢ启动子,一段发夹结构siRNA,一个RNA:polⅢ终止位点,能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。
获得了PVY的复制酶NIb基因和雪花莲凝集素GNA基因插入载体;构建了植物表达载体pBinGD,经分别转入烟草K326和马铃薯紫花白后获得了抗病毒、抗介体的双价转基因植物。
多数的siRNA表达载体依赖RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种,操纵一段45—50nt的发夹结构RNA(small hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达,shRNA在细胞内会自动被加工成为siRNA,从而引发基因沉默或者表达抑制。
磷酸钙共沉淀;电穿孔法;DEAE-葡聚糖和polybrene;机械法;阳离子脂质体试剂。
4、构建RNAi载体用的I型启动子和其他启动子有什么区别?用II型不行么...
它不必有强启动子,因为不重于表达。表达载体是基因克隆结束后,为了在特定细胞内表达而构建的。他重点在于表达,有各种各样的启动子适应于不同种类的细胞,并且有各种各样,如诱导等可控的表达调控方式。
肝细胞中表达的高活性启动子使小鼠过表达OPG (osteoprotegerin) 基因,得到的转基因小鼠的骨密度 明显高于正常小鼠,说明该基因参与骨质合成[4 ] 。
第一种可以直接或经由其他中介蛋白质的作用,而与负责转录的RNA聚合酶结合,再使聚合酶与启动子结合,并开启转录作用。第二种则与专门修饰组织蛋白的酵素结合于启动子上,使脱氧核糖核酸模板与聚合酶发生接触的难度改变。
在RNA复制酶作用下,按5;→3;方向合成互补的RNA分子。但RNA复制酶中缺乏校正功能,因此RNA复制时错误率很高,这与反转录酶的特点相似。RNA复制酶只对病毒本身的RNA起作用,而不会作用于宿主细胞中的RNA分子。
mRNA tRNA rRNA的区别:功能不同:rRNA是组成核糖体的主要成分。核糖体是合成蛋白质的工厂。rRNA一般与核糖体蛋白质结合在一起,形成核糖体(ribosome)。tRNA是分子最小的RNA,又称转运RNA。
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