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构建载体时用cds还是基因序列,载体构建测序成功

构建载体时用cds还是基因序列,载体构建测序成功

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  1. 构建载体时,比如过表达载体,35S启动子后边是连基因的CDS还是cDNA?
  2. 设计引物用cds序列和cdna序列的区别
  3. 基因表达载体的构建所需的条件

1、构建载体时,比如过表达载体,35S启动子后边是连基因的CDS还是cDNA?

在进行PCR之前,需要 ① 先针对自己的基因设计对应的 引物; ②提取与所需表达的基因同源的细胞或组织中的RNA,并经过RT程序将其转化为 cDNA; ③PCR扩增 出 所需要的基因片段。引物设计部分可参照前文。

当拿到一个基因的DNA片段后,就需要把它导入一个载体,一方面长期保存。另一方面也需要以载体为媒介将基因导入受体细胞中。基因表达载体的构建是基因工程的核心。常用的载体有细菌质粒,噬菌体和动植物病毒。其中质粒载体最常用。

构建cDNA文库时,需要将双链cDNA与表达载体连接起来,以便将目标基因表达出来。

是什么的引物,目的是什么?如果是检测基因的mRNA表达水平,可以逆转录,设计cDNA(cDNA包括5’和3’的非编码区和CDS序列)的引物进行RT-qPCR;如果是构建基因表达载体,就要根据CDS的序列进行引物设计。

cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多,能够比较容易从中筛选克隆得细胞特异表达的基因。

2、设计引物用cds序列和cdna序列的区别

是什么的引物,目的是什么?如果是检测基因的mRNA表达水平,可以逆转录,设计cDNA(cDNA包括5’和3’的非编码区和CDS序列)的引物进行RT-qPCR;如果是构建基因表达载体,就要根据CDS的序列进行引物设计。

CDS和cDNA之间的关键区别在于,CDS或编码序列是转录本中实际翻译成蛋白质的部分,为转录本 而cDNA序列是通过反转录从mRNA中衍生出来的DNA序列。cDNA是通过反转录从mRNA获得的DNA序列。

而CDS是检查cDNA后得到的编码组合序列,和实际情景比较接近。

对绝大多数基因而言,基因组DNA和cDNA差别很大,序列上有内含子的区别。首先你得明确你要什么,你要的片段在基因组和cDNA中的什么位置。

由于cDNA文库的复杂性和测序的随机性,有时多个EST代表同一基因或基因组,将其归类形成EST簇(EST clusteF)CDS是Coding sequence的缩写,是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语。

3、基因表达载体的构建所需的条件

作为一个基因表达载体,必须要满足以下条件:细菌的复制起始位点Ori;用来对转入质粒的细菌进行筛选的抗性基因比如:Kan Amp spec 等抗性筛选基因。

构建条件:必须能够在宿主细胞中复制,使重组基因能够在宿主基因中复制,从而稳定保存下来,这是作为运载体的必须条件。具有多个限制酶切点,从而可以使不同的粘性末端与之相连,增强实用性。

必须能够在宿主细胞中复制,使重组基因能够在宿主基因中复制,从而稳定保存下来,这是作为运载体的必须条件。

首先,能在细菌中稳定存在,有较高的拷贝数,具有选择标记的每一个标记基因都含有单一的酶切位点。其次,在复制时,需在特定的位点起始,具有特定核苷酸排列顺序的片段,即复制起始点。

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