载体构建用什么引物好-构建载体的原理
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1、构建的载体测序为什么不用基因的特异性引物而是用载体的通用引物?
通用引物和特异性引物的区别:前者是用来测序的通用做法,后者是一种测定基因突变的方法。通用引物 通用引物是一般和载体多克隆位点两旁的序列匹配,或者是与载体里面的一些启动、终止元件匹配。这样不管载体插入什么DNA片段,都可以用通用引物扩出来。通用引物可以用来测序,但是只是“通用”,也不是万能的。
使用通用引物可以进一步证明平板上生长的转化菌含有目的质粒,而不是污染了其他菌,也可以从某种程度上证明我们转化的质粒没有被污染。而使用目的片段引物虽然能检测到目的片段,但不能证明检测到的目的片段连在相应的质粒上面。
引物和目的基因是对应的,但引物的特异性是受到多种因素影响的。所以现在有primer premier等软件专门用来设计引物,因为引物的特异性受到反应条件、模板的影响。当模板就只有目的基因时引物是非常特异的,扩增出目的基因。
补充一个更重要和实际的考虑:实际测序中,可靠的测序结果往往是从引物后二三十个碱基才开始的。如果片段比较长,超过一次测序能力如七八百之外,即使双向测序也无法获得引物(排除非特异扩增)或紧邻引物处的序列时,就需要克隆到载体再测序。
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