cas9载体构建基因的ko质粒(cas9基因敲除步骤)
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1、怎么验证敲降的质粒
酶切产物电泳,质粒作对照,如完全切开只有以条带,位于质粒条带下方,同时参考marker确认大小。PCR产物酶切,如切下的部分很小,不易区分,但一般情况下,酶切后条带会变得更细,跟整齐些;如切下的部分较多,可通过大小判断。
说得不够详细。你提取好质粒之后是怎么验证的?单酶切验证还是双酶切验证?还是不酶切就直接电泳?确保酶切时间足够,以保证提取好的质粒完全切开。检查目的基因上或者载体上是否还有别的相同的酶切位点。第一点的可能性较大。另外,最好带上空载体做对照,从酶切到电泳,全程对照。
在一个平板上加入青霉素,则生长起来的是导入质粒的菌落,但这些质粒有可能是空质粒,有可能是导入目的基因的质粒。再拿六个平板,都加入四环素,分别在上一个平板上挑取单菌落,并分别图在六个平板上,不生长的对应菌落则是插入目的基因的质粒。
第一步,看箭头:大多数质粒都会有箭头,箭头有两种解释。一种是转录方向,转录方向主要是由启动子开始的一个大箭头,是启动子启动序列的顺序。另一种是复制起始位点的方向,复制起始位点就是该质粒在大肠杆菌等细菌或真菌中DNA复制的一个方向。
可以将pcr扩增好的DNA序列通过酶切连接的方式插入到pGL3载体的多克隆位点,拿到重组载体后,转化细胞,检测荧光变化,如果荧光比值明显增大,说明这一段DNA具有启动子活性。
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