如何构建大片段载体文件(如何构建大片段载体文件夹)
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1、大片段载体的分段构建二(两步PCR法)
首先一下是基因的全长,根据预实验结果,在红线那个位置分隔开,将其分成1-3010的 a 段及3011-6810的 b 段两个片段。一般来说4kb以下还是很好构建的。在设计引物时,需要将A片段的末尾和B片段的起始处设计出 15bp大小的重合序列(coincide),第一次PCR得到A、B两个片段,如图有15bp的重合序列。
载体构建的基本流程主要包括目的基因的获取、载体的选择和准备、目的基因与载体的连接、重组子的筛选与鉴定以及重组载体的扩增和纯化等步骤。首先,要进行目的基因的获取。这是载体构建的第一步,也是最关键的一步。可以通过PCR扩增、基因文库筛选、化学合成等方法获取目的基因。
一步法,使用特殊引物,全程只设置一个温度即可完成扩增。这种特殊引物有专利。二步法即循环扩增中设置2个步骤,这个方法主要扩增短片段,一个是95度变性,另一个是退火与扩增的温度,一般设置在55~60之间,当然也有例外。三步法就是平常见到的方法,扩增循环有三步,变性,退火,延伸。
设计一对引物,针对基因两端(覆盖酶切位点),在上游引物中酶切位点后的一段序列中添加一个碱基,扩增以后,酶切产物和空载体,再连接一遍,转化,小提拿去测序。最好上游换另一个内切酶位点,这样方便双酶切检测,区别于原来的质粒。
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