慢病毒载体构建和验证-慢病毒载体构建和验证的关系
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1、shRNA慢病毒载体合成步骤
要进行shRNA载体构建,首先需要根据自己的基因,设计出对应的 靶点 、 loop序列 , 酶切位点序列 ,详见 LncRNA的shRNA慢病毒载体引物设计 - 引物先用10000g在4°离心2min,再按照说明书的要求,加入DEPC或者无酶ddH2O将寡核苷酸稀释为100 μM。
方法依照shRNA设计原则,合成对应的shRNA序列,将其克隆到PHBLV载体中,使用三载体系统进行病毒包装,收集制备成功的病毒,并用荧光显微镜法测定病毒滴度,使用病毒感染EPC后,测定各组细胞中S1PR3蛋白表达情况,选择合适的病毒感染EPC后,测定其对EPC迁移能力的影响。
Tat是一种RNA结合蛋白,起到增强转录的作用。Nef蛋白抑制T细胞激活。Vpu能增强病毒进入过程中从细胞表面到细胞质中的释放。Vif蛋白是慢病毒复制所必须的,因为它能下调宿主的抗病毒反应 慢病毒载体来源于人类免疫缺陷病毒HIV,属于逆转录病毒家族。
慢病毒载体(Lentiviral vector, LVs)是在HIV-1病毒基础上改造而成的病毒载体系统,它能高效的将目的基因(蛋白质编码序列、shRNA或gRNA)导入动物和人的原代细胞或细胞系。
目前慢病毒也被广泛地应用于表达 RNAi 的研究中。由于有些类型细胞脂质体转染效果差,转移到细胞内的 siRNA 半衰期短,体外合成 siRNA 对基因表达的抑制作用通常是短暂的,因而使其应用受到较大的限制。
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